根据《食品安全国家标准 预包装食品标签通则》（GB 7718-2025）第 4.3.6 条规定，结合高温烤制面包工艺特点（产品经高温烘烤，添加的鲜酵母已完全灭活、终产品无活性酵母），对三种标识方式合规性答复如下： 

一、方式一：仅标识 “酵母” 该标识方式不合规。若对灭活菌种进行标识，仅标注菌种通用名称，未标注灭活相关说明，无法体现菌种无活性状态，不符合标准标识要求。 

二、方式二：标识 “酵母（经灭活）” 该标识方式合规。在企业自愿标识的前提下，该标注形式可清晰说明菌种灭活状态，符合 GB 7718-2025 中灭活菌种的标识规范。

 三、方式三：不予标识 该标识方式合规。依据标准规定，食品生产中添加、且经工艺完全灭活的菌种，可免于标识。

综上，高温烤制面包中已灭活的鲜酵母，可不标识；如需标识，应标注为 “酵母（经灭活）”；仅标注 “酵母” 不符合标准要求。